我的 MPICH 笔记

参考安装文档，并配置好运行环境。在 Rocks 系统上，可使用 mpi-selector 选择系统安装好的 MPICH 环境。

1. 启动 mpd 任务管理器

                                   $ mpd &
   
                               

2. 使用 mpdtrace 查看机器状态，其结果如下所示：

                                   $ mpdtrace
                                   node0
   
                               

3. 编写测试程序，比如 mpihello.c, 内容可以如下：

   #include <stdio.h>
                                   #include <stdlib.h>
                                   #include <mpi.h>
   
                                   int main(int argc, char *argv[])
                                   {
                                   int  numprocs, rank, namelen;
                                   char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
   
                                   MPI_Init(&argc, &argv);
                                   MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
                                   MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
                                   MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen);
   
                                   printf("Process %d on %s out of %d\n", rank, processor_name, numprocs);
   
                                   MPI_Finalize();
   
                                   return EXIT_SUCCESS;
                                   }
                                   

   然后使用 mpicc 进行编译：

                                   $ mpicc -o mpihello mpihello.c
   
                               

4. 使用命令 mpirun 运行编译后的程序

                                   $ mpirun -np 4 ./mpihello
                                   Process 1 on node0.hpc.cndc out of 4
                                   Process 2 on node0.hpc.cndc out of 4
                                   Process 0 on node0.hpc.cndc out of 4
                                   Process 3 on node0.hpc.cndc out of 4
                               

   其中参数 -np 表示需要使用的 CPU 数目。

1. 与本地测试同样的步骤，第一步需要启动 mpd 任务守护进程。所不同的是并不是直接调用 mpd 进程，而是通过 mpdboot 来启动。

   1. 首先，需要准备一份参与计算的机器列表文件，比如 mpd.hosts, 其内容大致如下：

                                          compute-0-0
                                          compute-0-1
                                          compute-0-4
                                          compute-0-2
                                          compute-0-3
                                          compute-0-5
                                      

      当然，需要在你的 /etc/hosts 文件中首先定义好所有的主机名。

   2. 然后执行 mpdboot 命令

                                          $ mpdboot -n 6 -f mpd.hosts
      
                                      

2. 然后执行 mpdtrace 查看参与计算的节点是否打开

                                   $ mpdtrace
                                   node0
                                   compute-0-0
                                   compute-0-2
                                   compute-0-1
                                   compute-0-4
                                   compute-0-3
                               

3. 编译测试程序，比如 mpich2 中自带的示例 cpi.c:

                                   $ mpicc -o cpi cpi.c
   
                               

4. 使用 mpirun 执行编译后的程序

                                   $ mpirun -np 6 ./cpi
                                   Process 0 on node0.hpc.cndc
                                   Process 2 on compute-0-2.local
                                   Process 1 on compute-0-0.local
                                   Process 3 on compute-0-1.local
                                   Process 4 on compute-0-4.local
                                   Process 5 on compute-0-3.local
                                   pi is approximately 3.1416009869231249, Error is 0.0000083333333318
                                   wall clock time = 0.005853